本文目录一览：
- 1、如何破解新冠病毒基因组全长序列？
- 2、有没有什么办法可以改变病毒基因？
- 3、研究发现多达84%的新冠肺炎患者出现后遗症，这种情况是否可逆？
- 4、2020中国疫情时间轴？
- 5、超2亿个缺失的人类基因组首次破译，为什么说这是世界上最复杂的谜题之一？
如何破解新冠病毒基因组全长序列？
正如如大家所知，高通量测序在新冠病毒的鉴定及诊断中可以和RT-PCR法形成互补，这样不仅能够提高阳性检出率，而且还能进行并发检测，以提供更多的可能感染的病原信息。其中更为重要的是，高通量测序还可以对病毒的序列进行组装，以获得病毒的全长基因组信息，这样为追溯病毒的来源、监测病毒的变异趋势以及探究致病机理提供了研究基础。
科学家们为了获取完整的病毒基因组的序列，目前广泛应用到的高通量测序技术，就是将核酸序列打断成短片段从而进行测序，然后通过相应的分析软件将测得的短序列再进行拼接组装。然而，新型冠状病毒是一种新发病毒，人们在基因测序的深度、测序准确性以及重复序列比例等方面，到目前来讲还没有形成具有参考意义的经验值。那么也就是说如果要将海量的短序列还原出原始的基因组序列，则有可能会在序列拼接中出现以下问题：首先，出现测序错误，从而导致某些重叠的可信度低；再者，基因组序列的不完全覆盖以及高重复序列的干扰会影响基因短序列拼接的准确性和完整性；最后，宏转录组测序样本中的人源序列占到了85%以上，而病原序列仅占到5%左右，这就使得病毒基因组序列的拼接难度更高。
了为避免样本在采样、保存和运输过程中因不确定性而导致提取的核酸含量出现较大地差异，我们现在有两种方案：第一种是对于核酸含量高的样本建议进行rRNA去除再建库；第二种是对于核酸含量低的样本，直接进行RNA的建库，并加大基因测序深度。
通过病原鉴定系统对COVID-19序列进行数据分析并采用IDBA的方法完成基因的拼接。
有没有什么办法可以改变病毒基因？
我们生活的世界上有着很多种不同的生物，因为种类不同所以每个物种都不一样，而且每个相同的物种也因为基因的不同也会出现不同的模样。这就是基因的魅力，所以基因的序列不同和基因的选择性表达会产生不同的情况，而最近也因为新冠病毒肆虐，很多人也想到通过基因问题来改变现状，那么有没有什么办法可以改变病毒基因？基因本身就有着基因突变的说法，因此改变基因的办法有很多，使用化学试剂和物理射线。
一般的生物的成长都会有细胞分裂这个环节，因为细胞是生物体最基本的部分，而在细胞分裂的时候就会出现基因链紊乱的情况，从而改变基因。但是我们需要知道的是，病毒不是细胞，因此我们在改变病毒基因的时候，不能采取细胞生物的办法，我们需要在病毒寄生在宿主细胞时下文章。
我们都知道，病毒是没有生命的，他的生命活动必须依附宿主细胞，而且病毒的繁殖方式也是通过复制来完成的，因此我们想要改变细胞基因就需要，当病毒进入宿主细胞时，且进行遗传物质的复制、转录、和转译时，我们向宿主细胞中注入一些影响某些物质表达的化学试剂，从而导致病毒基因的改变，但是这种改变方式往往是不定向的，而且改变了也没有多大的用处。
现在随着生物科学的不断进步，和其他的一些基础科学的不断成长，我们出现了很多精密仪器，为了能改变生物的基因也就出现了基因工程，我们在经过分析之后，就能明确的判断出改变哪段的基因片段效果最好，最后实现定向修改。所以我们相信未来可期，阳光总在风雨后，疫情之后，美好的生活在迎接我们。
研究发现多达84%的新冠肺炎患者出现后遗症，这种情况是否可逆？
目前还没有任何报告或者事实证明可逆转，因为目前尚无关于患者康复后的信息，对这些拥有后遗症的患者而言，到底要怎么解决跟处理，这是国际卫生组织的问题了，我们作为旁观者不需要去评论。我们也非常清楚，新冠疫情对我们全世界的打击有多大，虽然现在新冠疫情有所控制，但是，整体而言还是没有好转，特别是西方许多国家，已经在接近崩溃的边缘，新冠疫情是我们全人类的敌人，可能正是因此缺乏关于新冠病毒对患者长期后遗症影响的数据，才直接导致该研究仅分析了7例病例，实际上，就以上的问题，我个人有以下的几个看法：
一、基因的突变是最糟糕的
如果新冠疫情一直存在，那么全世界就不可能有好的日子，关于这个问题的问题，我是有一个非常可怕的想法的，我个人认为，新冠疫情非常有可能会一直存在，无法消失，在最新的研究报告做，证明了新冠疫情是可以无声无息存在的，大到我们人类身体，小到空气，如果是存在，这还是容易处理的，但是，因为计划赶不上变化的原因，新冠疫情一直在发生严重的基因突变，所以，才导致了我们全世界的医疗无法解决这个问题。
二、冠状病毒多样性
实际上，在我个人看来，可能除了流行的新冠病毒外，还有很多其他的冠状病毒，这些病毒可能看上去跟新冠一样，但是，他们的病毒跟基因都是不同的，但是，他们都可以感染人类，其中有4种是可以直接引起普通感冒的，目前这两种还是比较容易控制的，其次，还有另外两个是可以直接致命的。
三、新冠疫情的危害性
新冠疫情让许多家庭家破人亡，这是毋庸置疑的，与2019年12月爆发的新冠肺炎相比，全球死亡人数大概已超过30万，并且到现在为止，全世界的死亡病例仍在上升。
2020中国疫情时间轴？
部分时间轴：
2019年12月31日，武汉市卫健委公开通报了一种不明原因的肺炎情况。
12月26日开始，湖北省中西医结合医院呼吸与重症医学科主任张继先陆续接诊多例奇怪的肺炎病人：先是肺部CT表现一样的一家三口，然后是一个华南海鲜市场的商户。
12月27日，张继先把这4个可疑病例向医院做了汇报，医院上报给武汉市江汉区疾控中心。
12月29日，湖北省中西医结合医院再次上报7例聚集性不明原因肺炎病例。
12月30日一早，张定宇带领团队采集该院最早收治的7名病人的支气管肺泡灌洗液，并送往中科院武汉病毒所进行检测。
12月31日，国家卫健委前方工作组乘坐第一班北京飞武汉的航班到达。第一批专家组随后抵汉。
31日下午，该直报系统收到“武汉江汉区武汉华南海鲜市场聚集性肺炎疫情”的报告。
2020年元旦，国家卫健委一位负责人带领有关人员，赴武汉督促指导当地疫情防控工作。
1月1日上午8时，国家疾控专家抵达华南海鲜市场，针对病例相关商户及街区集中采集环境样本515份，运送至病毒所检测。
1月2日，接到湖北省送检的病例标本，中国疾控中心生物安全首席专家武桂珍和病毒病所谭文杰团队、赵翔团队等迅即投入一场破译病毒遗传密码的“接力赛”。
24个小时后，病毒的全长基因组序列被破解。基因组比对结果显示，该病毒与已知的冠状病毒差别较大，与SARS的相似性为82%。
1月3日，中国疾控中心、中国医学科学院、中科院武汉病毒所、军事医学科学院四大顶尖科研机构开展了对病例样本的实验室平行检测。
1月5日，世界卫生组织首次就中国武汉出现的不明原因肺炎病例进行通报。
1月7日，锁定新冠病毒“真凶”的重要实验证据出炉。中国疾控中心在电镜下观察到典型的冠状病毒的颗粒形态，成功分离首株新冠病毒毒株。
1月9日，国家卫健委专家评估组对外发布武汉不明原因病毒肺炎病原信息，病原体初步判断为新型冠状病毒。
1月7日，习近平总书记主持召开中央政治局常委会会议时，对新型冠状病毒肺炎疫情防控工作提出了要求。
1月8日，国家卫健委第二批专家组抵达武汉，修订完善了新冠肺炎的诊疗、监测、流行病学调查处置、采样检测等方法。
1月13日，世界卫生组织发表声明说，已收到在泰国确诊一名中国旅客感染新型冠状病毒的报告。
1月18日，84岁的钟南山院士从广州挤上了开往武汉的列车。
1月19日，高级别专家组上午参加疫情研讨会后，立刻前往武汉金银潭医院和武汉疾控中心实地调研。中午来不及休息，下午开会到5点，又登上飞往北京的航班。
1月20日一早，6位高级别专家走进中南海，直接面对决策层，汇报了对疫情的研判意见。
1月20日，国家卫健委发布公告，将新冠肺炎纳入传染病防治法规定的乙类传染病，实行甲类管理。由国家卫健委牵头，包括30多个部门的联防联控工作机制成立。
1月22日，湖北省启动重大突发公共卫生事件Ⅱ级应急响应，2天后升级为Ⅰ级响应。
1月23日，武汉落实党中央决策部署，关闭了离汉通道。
从1月23日起，30个省区市相继启动“重大突发公共卫生事件I级响应”，制定落实社区的防控措施，实行网格化、地毯式管理。
扩展资料
1月23日10时，武汉“封城”。
1月23日上午，浙江省率先启动重大突发公共卫生事件一级响应。
1月23日晚，湖南省和广东省宣布，启动重大突发公共卫生事件一级响应。
1月24日，北京、上海、天津、安徽、重庆、四川等地陆续启动重大突发公共卫生事件一级响应。
大型活动，取消；活禽和野生动物，禁售；旅行社团队游，停止；公共场馆，限流、测温；火车站、高铁站、汽车站、飞机场，消毒、通风、重点防控……一系列应急措施以冲刺的速度出台，筑起护卫人民生命安全和身体健康的一道道防线。
当农历新年的阳光洒向神州大地，1月25日，农历正月初一，习近平总书记主持召开中共中央政治局常委会会议，专门听取疫情防控工作汇报，对疫情防控特别是患者治疗工作进行再研究、再部署、再动员。
在这样的时点召开这样的会议，史无前例。
参考资料来源：中国军网-众志成城——2020中国抗击新冠肺炎疫情纪实
参考资料来源：中国文明网-同舟共济战“疫”记——中国抗击新冠肺炎疫情全纪实
超2亿个缺失的人类基因组首次破译，为什么说这是世界上最复杂的谜题之一？
历时22年，研究人员终于从头到尾破译了完整的人类基因组序列。
钛媒体App4月1日消息，据科技日报，全球顶级期刊《Science》（科学）杂志今天凌晨连发6篇论文报告，公布了人类基因组测序的最新进展：国家人类基因组研究中心(NHGRI)组成的端粒到端粒 (T2T) 联盟科学团队，通过新的技术研究出全球第一个完整的、无间隙的人类基因组序列，首次揭示了高度相同的节段重复基因组区域及其在人类基因组中的变异。
这是对标准人类参考基因组，即2013年发布的参考基因组序列（GRCh38）的“重大升级”，增加了之前整条染色体上隐藏的DNA片段，破译了缺失的大约2亿个DNA碱基对以及2000多个新基因——占人类基因组的8%。
这篇研究成果意义重大。科研人员揭示的完整人类基因组序列，是世界上最复杂的谜题之一，这一研究使得人类第一次看到最完整的、无间隙的DNA碱基基因序列，对于人类了解基因组变异的全谱，以及某些疾病的遗传贡献至关重要，将会推动与癌症、出生缺陷和衰老相关的研究与科学发展。
同时，这也是《Science》创刊141年来，首次在同一期杂志中连发6篇论文揭示人类基因组研究。
本论文作者，圣路易斯华盛顿大学医学院遗传学家Ting Wang（音译：王庭）表示，此次拥有完整的基因组，一定会改善生物医学研究。“毫无疑问，这是一项重要的成就。”
据中国科学报，人类基因组计划参与者、中国科学院北京基因组研究所研究员于军表示，假如把人类基因组序列比作一辆非常复杂的汽车，那么与20年前完成的人类基因组草图相比，完整的新序列非常于增添了更多零件。
“我们看到了以前从未阅读过的章节，”本论文通讯作者，华盛顿大学霍华德-休斯医学研究所（HHMI）研究员Evan Eichler（艾希勒）表示，这是全行业的一件大事。
Science封面图研究人员到底破译了什么？人类基因组由超过60亿个独立的DNA碱基、大约2-3万个蛋白质编码基因（整个基因仍未有统一答案）组成，与黑猩猩等其他灵长类动物的数量差不多，分布在23对染色体上。为了读取数以万计的基因组，科学家们首先将所有的DNA链切成几百到几千个单位长度的DNA片段。然后用测序机器读取每个片段中的各个碱基，科学家们试图按照正确的顺序组装这些片段，就像拼凑一个复杂的拼图。
2001年2月12日，由6国科学家共同参与的国际人类基因组计划首次公布人类基因组图谱及初步分析结果；2003年4月15日，公布了人类基因组序列草图。
然而，由于技术限制，当初的人类基因组计划留下了大约8%的“空白”间隙。这部分很难被测序，由高度重复、复杂的DNA块组成，其中包含功能基因以及位于染色体中间和末端的着丝粒和端粒。
实际上，核心的挑战在于，基因组的某些区域反复重复相同的碱基。重复的区域包括着丝粒和核糖体DNA等，过去无法按照正确的顺序组装一些被切碎的片段。这就像拥有相同的拼图碎片一样，科学家们不知道哪块碎片在哪里，因此基因组图中留下了很大的空白。
而且大多数细胞包含两个基因组--一个来自父亲，一个来自母亲。当研究人员试图组装所有的片段时，来自父母双方的序列可能混合在一起，掩盖了个体基因组内的实际变异。
如今，研究人员通过新的纳米机器设备与核心技术，实现了新的无间隙版本T2T-CHM13，由30.55亿个碱基对和19969个蛋白质编码基因组成。增加了近2亿个碱基对的新DNA序列，包括99个可能编码蛋白质的基因和其中近2000个需要进一步研究的候选基因。
这些候选基因大多数是失活的，但其中115个仍然可能表达。团队还在人类基因组中发现了大约200万个额外的变异，其中622个出现在与医学相关的基因中。此外，新序列还纠正了GRCh38中的数千个结构错误。
近端着丝粒染色体的显示图样（来源：论文）
具体而言，新序列填补的空白包括人类5条染色体的整个短臂，并覆盖了基因组中一些最复杂的区域。其中包括在重要的染色体结构中及其周围发现的高度重复的DNA序列，如染色体末端的端粒和在细胞分裂过程中协调复制染色体分离的着丝粒。
此外，新序列还揭示了以前未被发现的节段重复，即在基因组中复制的长DNA片段，并揭示了关于着丝粒周围区域的前所未见的细节。这一区域内的变异性可能为人类祖先如何进化提供新证据。
值得一提的是，本研究成果的关键进展，其实是利用了新的技术设备——英国牛津纳米孔技术公司和太平洋生物科学公司制造的快速迭代的基因测序机器。
早在2017年，国家人类基因组研究中心(NHGRI)负责人Adam Phillippy（亚当-菲利皮），以及加州大学圣克鲁兹分校(UCSC)的凯伦-米加意识到，新的纳米孔机器实现了一次准确读取100万个DNA碱基的能力，可以为最终解决基因组难点打开了大门。
大约在同一时间，华盛顿大学霍华德-休斯医学研究所（HHMI）Evan Eichler（艾希勒）领导的科研团队已经证明，使用太平洋生物科学公司的设备技术，可以解决更复杂形式的遗传变异技术。
因此，三人一起创办了端粒到端粒（T2T）联盟，利用全球约100名科学家团队资源，使其加快了研究佳偶。
随后，该团队连续六个月不间断地利用快速迭代的纳米孔基因测序机器，并请来几十位科学家来组装这些基因片段并分析结果。最终利用设备、技术等，实现了长读数测序读数，并将长读测序与牛津纳米孔的数据相结合，准确率超过了99%，填补了全球基因学研究的空白。
一直到2020年夏天，该团队已经拼上了两条染色体。在新冠疫情爆发的期间，团队通过Slack等通讯工具进行远程工作，获得了另外21条染色体，将每个染色体从一端或端粒排序到另一端。而且，科研人员人员还试图组装基因组中最难的区域，即着丝粒中高度重复的DNA序列。
最终，通过长时间的研究与团队合作，该团队成功实现了对每个染色体进行了测序，包含了编码用于制造核糖体的RNA的基因的多个拷贝，总共400个。
2021年6月，这份研究成果首次发表在预印版平台bioRxiv上。经过同行评议等，如今一系列论文登上了《Science》（科学）杂志。
研究人员在会后采访中表示，下一阶段的研究将对不同人的基因组进行测序，以充分掌握人类基因的多样性、作用以及人类与近亲、其它灵长类动物的关系。
年增速超20%，中国百亿基因市场前景广阔
随着生物学技术的不断发展，新的行业层出不穷，本次研究成果所属的中国基因测序行业是一个百亿级市场，拥有广阔的发展前景。
根据千际投行的研究统计数据显示，早在2019年，基因测序所在的全球生物制品行业市场规模就达到了3172亿元，未来五年有望达到万亿级别。其中，2019年中国基因测序行业市场规模约为149亿元，年增速超20%。
近年来，基因测序行业得到迅速发展，吸引了大量资本和企业的进入。从产业上下游来看，基因测序产业链主要包括了上游仪器、中游服务提供商以及下游终端应用三个环节。涉及到的公司包括华大基因、达安基因、药明康德，以及互联网巨头苹果公司、亚马逊、谷歌、微软等。
整个产业看似简单，但上游的基因测序仪及配套试剂是整个产业链壁垒最高的部分，下游终端应用还涉及领域覆盖面非常广，既包括医疗领域的人体基因组、人体微生物基因组以及基础研究领域，还包括非医疗领域的环境治理、石油存储探测、农牧软文种等。
实际上，早在几十年前，医学界就对此有过尝试，将狒狒的心脏移植给了一个罹患先天性心脏病的孩子。如今，通过嵌合的方式，通过基因编辑的方式，甚至是通过合成生物学的方式，实现了猪心脏在人类身上的移植。
华大集团CEO尹烨曾表示，其实，今天人类进入了生命时代，我们关心的则是自身的基因和健康，以此就将去整合物理世界、信息世界和生命世界。
在应用场景不断拓宽，测序能力进一步加强的共同促进作用下，全球基因测序行业市场规模将不断增长，中国基因行业市场规模虽然与全球头部企业差距较大，但是在国内市场中仍然占据较大的优势，未来要想提高国际市场份额，还需进一步加强技术研发，未来发展具有巨大的想象空间。
今天，新的基因组序列研究成果，是科研人员必不可少的第一步，也是实现商业化的重要一步。
Evan Eichler（艾希勒）表示，“现在我们有了一块罗塞塔石碑（注：一块制作于公元前196年的花岗闪长岩石碑，解读出已经失传千余年的埃及象形文之意义与结构），可以在未来研究数十万个其他基因组的完整编译。”